无公害蔬菜生产，基肥应以有机肥为主，混拌入适量的化肥。基肥施用量应占作物总施肥量的70%以上。其中植物残体肥或土杂肥等有机肥和矿质磷肥、草木灰全数作基肥，其他肥料可部分作基肥。在确定基肥的品种和数量时应特别注意以下几点：
1.要防止造成肥料浓度障碍。如果使用过量的化肥作基肥，能造成局部的高浓度肥料障碍。而有机肥缓效，缓冲性大，即使大量施用，也很少发生浓度障碍。因此，蔬菜基肥施用总量不足时，只能通过增加有机肥的数量来满足。
2.少用硝态和铵态氮化肥。蔬菜是喜硝态氮作物，但硝态氮化肥施入土壤不易被土壤吸附，易被雨水或灌溉淋失，故不宜大量作基肥;铵态氮化肥施得太多，会发生严重的生育障碍，出现叶色黄化或萎缩现象。同时还会影响作物对钙、镁肥的吸收，也不宜大量作基肥。因此，应该用酰胺态氮肥(尿素)为好。氮素肥料中，供给作物氮量的70%作基肥，30%作追肥。在作追肥的30%氮素肥中，化肥应占3/5。有机氮素肥如人的粪、尿，作追肥时仅在蔬菜作物的定植初期使用。
3.磷肥应全数作基肥。一般来说，蔬菜对磷肥的吸收量，以氮素为100时，则为25～30。蔬菜生育中需要磷肥的关键时期是在生育的初期，如果苗期磷肥不足，即使后期补施大量的磷肥，产量还是会降低。所以磷肥一般全数作基肥。
