烟草的基肥一般将全部的农家肥、磷、钾肥和60%左右的氮肥一次施入。追肥：约40%的氮肥作追施，追肥可分2次进行。对烤烟、晒黄烟和白肋烟来说，不应晚于栽后30天;而晒红烟和雪茄烟的追肥可晚至开顶肥。烟草施肥常用穴施、开沟条施和兑水淋施。施肥深度均应在5-20厘米土层内。烟草同时施用铵态氮和硝态氮效果好：早期不易出现氮素不足，后期氮素过剩的情况。符合烟草“少时富，老来穷”的需肥规律，有利于烟草正常落黄，容易烘烤，燃烧性好。烟草对氯很敏感，叶片含氯超过1%时，会造成叶片燃烧不良，严重时出现熄火。所以应少用含氯较多的肥料，以及用它作原料的复混肥料。烟草吸收的钙仅次于钾元素，也容易出现锌素营养不足的现象，要及时补充土壤中钙、锌元素的不足。
